گروه علوم آزمایشگاهی در سال 1370 با هدف تربیت نیروی متخصص مورد نیاز در آزمایشگاه‌های پزشکی منطقه در مقطع کاردانی در اداره آموزش پیراپزشکی تأسیس و سپس در سال 1375 با تصویب مقطع کارشناسی آن، دانشکده پیراپزشکی تاسیس و راه اندازی شد. ماموریت برنامه علوم آزمایشگاهی بالینی (CLS) در دانشگاه علوم پزشکی کاشان، ارائه آموزش با کیفیت بالا به منظور تربیت کادر فنی و کارشناسی و آماده سازی افراد آموزش دیده و دارای شایستگی و دانش کافی برای خدمت به حرفه علوم آزمایشگاهی بالینی است. امروزه بیش از 70 درصد از تشخیص‌های بالینی در سیستم سلامت بر اساس تشخیص‌های پاراکلینیکی است که آزمایشگاه در این زنجیره نقش بی بدیلی در ارائه مستندات تشخیصی بر اساس یافته‌های مستخرج از نمونه‌هایی مانند خون و سایر مایعات بیولوژیکی بدن دارد و فارغ التحصیلان این رشته با نقش آفرینی بعنوان کارشناس در آزمایشگاه اطلاعات لازم را جهت تشخیص دقیق بیماری در اختیار شبکه سلامت قرار داده و یا با ادامه تحصیل در رشته‌های علوم پایه مثل میکروب شناسی، انگل شناسی، بیوشیمی، ایمنولوژی، هماتولوژی و ..... بعنوان محقق و یا هیات علمی در مراکز تحقیقاتی و دانش بنیان و دانشگاهها ایفای نقش کنند.